Genómica Forestal

Reseña

El área de genómica forestal se creó en 2005, año que además este grupo de investigación se adjudicó el Consorcio Tecnológico en Genómica Forestal. Este logro permitió la incorporación de investigadores y a la vez comenzó un trabajo de capacitación y formación para ellos en genómica forestal. En paralelo, se gestionó la creación de una nueva carrera en 2006: Ingeniería en Biotecnología Vegetal en la Facultad de Ciencias Forestales. Gracias a esta carrera se pudo contar con el apoyo de tesistas de pregrado y posteriormente de doctorado. Al día de hoy, en esta área se han formado cerca de 40 profesionales y al menos 6 doctores y magister, todos enfocados en genómica forestal.

Actualmente, el grupo está compuesto por 20 personas.

Antes de que se inaugurara el CB-UdeC, el primer proyecto adjudicado por el grupo de investigación tuvo relación con tolerancia frío con Eucalyptus globulus. Se inició un trabajo colaborativo con el Laboratorio de Recursos Renovables y las principales empresas forestales del país. Al alero del Consorcio de Genómica Forestal se definieron 4 áreas de desarrollo: formación de madera, tolerancia a patógenos en caso de pino radiata, para luego continuar la investigación en tolerancia al frío.

Actualmente, hay trabajos y proyectos en detección de patógenos agrícolas y forestales empleando herramientas moleculares.

Investigadores

1 – Dra. Sofía Valenzuela Águila (Encargada de Laboratorio).
2 – Dra. Marta Fernández Reyes.

Descripción

El objetivo del grupo de investigación es desarrollar herramientas biotecnológicas que permitan predecir el desempeño y/o características de interés silvoagrícola de especies leñosas, para su uso comercial o de conservación. Nuestro grupo desarrolla investigación en cuatro áreas principales:

• Generación de marcadores moleculares SNPs, microsatélites, AFLPs, para análisis de variabilidad genética, estudios de genética poblacional, certificación clonal y análisis de genética cuantitativa.

• Identificación de genes de interés, asociados a características de importancia agroforestal, elucidando la función que desempeñan en la formación de madera, resistencia a estrés biótico y abiótico.

• Desarrollo de metodologías bioinformáticas para el análisis de datos masivos obtenidos por técnicas de secuenciación de segunda generación (Next-generation sequencing), en estudios RNA-Seq y GBS.

• Implementación de técnicas de diagnóstico molecular, que permitan identificar organismos patógenos silvoagrícolas.

Proyectos

1. CORFO 05-CTE-04. Consorcio Genómica Forestal. Programa Bicentenario de Ciencia y Tecnología. Directora científica: Sofía Valenzuela. 2005- Octubre 2012.

2. FONDEF D10i1221. Eucachip: Herramienta de selección genómica para la industria de biocombustibles de segunda generación. Directora: Sofía Valenzuela. Noviembre 2011-Noviembre 2014.

3. FONDECYT 1130780. Dehydrins: do they confer frost tolerance in eucalypts?. Directora: Sofía Valenzuela proyecto. 2013-2016.

4. IdeA-Fondef ID14I-10068. Nuevo biopesticida basado en bacterias inductoras de resistencia para el control de la bacteriosis del kiwi-PSA. Director alterno: Sofía Valenzuela. 2015-2016.

5. FONDECYT 11121559. mRNA-Seq platform for the frost tolerance analysis of Eucalyptus globulus, Eucalyptus nitens and the hybrid E. nitens x E. globulus. Directora: Marta Fernández. 2012-2015.

Publicaciones

1. Valenzuela, S and Strauss, S. 2005 Lost in the woods. Nature Biotechnology. 23(5): 532-533.

2. Fernández M., Valenzuela S., Arora R., Chen K. 2012. Isolation and characterization of three cold acclimation-responsive dehydrin genes from Eucalyptus globulus. Tree Genetics and Genome. DOI 10.1007/s11295-011-0429-8

3. Moraga-Suazo, P., L. Orellana, P. Quiroga, C. Balocchi, E. Sanfuentes, R. W. Whetten, R. Hasbún, and S. Valenzuela 2014. Development of a genetic linkage map for Pinus radiata and detection of pitch canker disease resistance associated QTLs.Trees Structure and Function. DOI 10.1007/s00468-014-1090-2.

4. Garcia, R; Anderson, N; Lefeuvre, R, Iturra, C; Elissetche, J, Chapple, C and S. Valenzuela. 2014. Rescue of syringyl lignin and sinapate ester biosynthesis in Arabidopsis thaliana by a coniferaldehyde 5-hydroxylase from Eucalyptus globulus. Plant Cell Reports. DOI 10.1007/s00299-014-1614-7.

5. Donoso, A; Rodríguez, V; Carrasco, A; Ahumada, R; Sanfuentes, E and Valenzuela S. 2015. Relative expression of seven candidate genes for pathogen resistance on Pinus radiata infected with Fusarium circinatum. Physiological and Molecular Plant Pathology. 92:42-50.

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49 years ago